突破难点,创造新的测序平台
但一些DNA聚合酶会把DNA模板复制到互补的核苷酸链中,从而导致纳米孔内出现冗余电流,这种情况下该方法会变得很复杂。
本文第一作者之一,Church实验室的博士后研究员P. Benjamin Stranges说,“当前该方法面临的最关键问题是缺乏准确性,因合成多个互补DNA链且向着纳米孔靠近,这产生了冗余的电子信号,这些电子信号也会进入到纳米孔中,导致最终测序结果的不准确性。如今,我们设计了一个新的测序机器,它可以提供更强大、更可靠地测序结果,并且能高度复用在数百个纳米孔的芯片中。”
这种新的测序仪器包含了7个蛋白质亚基,这些亚基构成了一个纳米复合物,其中一个亚基能精准地与纳米孔开口处的DNA复合酶偶联。该平台能够在同一芯片上复用并同时分析多个DNA序列的电位差异,因而与传统测序方法的吞吐量以及设备成本相比较,它具有大幅降低测序成本的潜力。
本文的第二作者, Wyss研究所的研究人员Mirkó Palla博士说,“我们能识别出79%-99%之间的正确核苷酸,背景噪音捕获少于1.2%,这是纳米-SBS系统的一个显著进步。”
哥伦比亚大学基因组技术和生物分子工程学院的医生们也参与了该研究。Wyss研究所主任Donald Ingber医学博士说,“这是一个典型地例子表明人类如何从分子水平上深入了解活体生物,并利用其带来突破性的技术。通过将生物大分子机器与合成纳米孔膜两者结合,再整合到常规的电子机器中,Church团队开发了一种技术,它可以创造全新的、低成本的基因诊断工具。”
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