Nature子刊:NIPT应延伸至常见染色体三体之外的检测
在此之前,本文作者曾发表研究对其cfDNA检测方法进行验证。他们的cfDNA检测方法覆盖面更广泛,包括常见的染色体三体、性染色体异常(SCAs)、罕见染色体三体和CNVs。
在新研究中,研究人员全程随访6388例连续单胎妊娠,比较了NIPT结果和产后诊断/验证检测结果。与其早期研究不同,该研究整合了胎儿分数测量(fetal fraction measurements)和胎儿cfDNA富集过程,并结合信号统计方法确定了假阳性结果的主要来源,区分了真阳性和假阳性,同时还建立了复发性致病CNVs的检测阈值。
总体而言,在6388例样本中,将近四分之一(258例)被认为异常或可能异常,其中包括199例常见的染色体三体、53例SCAs、50例罕见的染色体三体和36例CNVs,其他6130例样本被认为正常或可能正常。
除了199例常见的染色体三体被归为异常或可能异常外,还有15例样本由于统计分数低于临界阈值被视为临床意义不明。在53例SCAs中,38例为单倍体X,10例为三X染色体综合征,5例为Klinefelter综合征。根据作者所述,CNVs在反复重排、与常见基因组疾病相关的重叠基因组区域中最为常见,研究人员在DGS区域22q11.2和16p13.11区域中分别检测到了两个缺失和两个重复。同时,通过对检测结果和妊娠结果的随访与追踪,研究人员确定了假阳性和所有变异的负利率。
此外,研究人员报道了常见染色体三体的高检测率和低误报率,总体而言,所有样本中只出现2个假阴性,且均在T18上,一个由于低胎儿分数所致,另一个可能是胎儿嵌合体所致。作者在文中写道,与早期的技术验证研究相比,该研究中性染色异常表现出了类似的结果,罕见常染色三体的检测精度也相一致,CNV数据可密切反映阳性预测值。因为目前缺乏非复发性CNVs的表型结果数据,研究人员认为通过这6000多个数据,可建议将基于cfDNA的NIPT筛查范围扩展至罕见的常染色体三体和与基因组疾病显著相关的CNVs。
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