来源:生物谷
【1】封面故事:抗生素抗性基因的分布和扩散图
doi|10.1038/nature17672
本期封面所示为秘鲁首都利马位于城乡接合部的一个贫穷棚户区,名叫“Pampasde San Juande Miraflores”。绘制抗生素抗性基因的分布和扩散图是公共卫生方面的一项优先任务。Gautam Dantas及同事定性了来自拉丁美洲两个低收入社区的细菌群落结构和抗性基因交换网络,这两个社区分别是萨尔瓦多首都圣萨尔瓦多以南35公里的一个由自耕农组成的村庄和秘鲁首都利马西南大约15公里的沙丘地带的一个棚户区。通过对数百个相互联系的人类粪便和环境样本进行功能基因组学研究和全元基因组测序(whole-metagenome sequencing),作者发现,不同生境的“抗性组”(resistome)的结构一般是由细菌系统发育(bacterial phylogeny)沿生态梯度决定的,但关键抗性基因能穿过这些边界。他们还对粪便管理方式在防止抗性基因扩散中所起作用进行了评估。综合起来,这项工作为对抗生素抗性基因在各种不同环境中的传播进行定量风险评估和监测奠定了基础。
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